对付天花病毒，欧阳轩提出的牛痘接种法是最好的预防手段。由于牛痘病毒和天花病毒共有交叉反应抗原，所以可以诱发机体产生自动免疫以预防天花。这项技术是从感染天花的牛身上取出脓汁和痂皮，接种到健康人的身上使之获得免疫力。事实上霹雳军早在去年便研发出了这种技术，余柱带到流求的士兵和技术人员便是第一批接种者。只不过霹雳军牛只缺乏，不仅要用于耕地也用于在矿山和工厂作为动力，实在腾不出多少来牛来用于提取疫苗。牛是重要的战略物资，但购买要比战马容易的多，故经过一年贸易已积累了不少牛只。有了充足的牛只，欧阳轩和唐顺商议之后，便决定在霹雳军境内大规模接种牛痘。

预防医学的另一个重要方面便是消毒剂的研发和生产。虽然欧阳轩是化工专业，但要在当下的生产条件下，大规模生产出含碘、含氯、含醇消毒剂来，也是不现实。一方面是工业生产条件不达标，别一方面也是成本实在太昂贵了，根本无法大面积使用。故欧阳轩和唐顺商议，一方面继续改进消毒剂的生产工艺，待原材料充足时再行生产。另一方面则是采用传统的消毒方式，如用火焚烧、用沸水烫。草木灰浸出液也是很好的消毒剂，当然使用的最多的，还是生石灰及其制成的消毒剂，量足又便宜。

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